左侧肾结石通常引起左侧疼痛，这一点相对容易区分，但急性阑尾炎和右侧肾结石会导致右侧腹部疼痛。有时只凭症状难以区分二者，这时可以先进行体格检查。阑尾炎会在右下腹McBurney点压痛和反跳痛，而右侧肾结石压痛位置较高且无反跳痛。肾结石还可能在后背肾区叩击时疼痛。其次，可通过血常规和尿常规进行鉴别。阑尾炎通常伴有明显白细胞增高和中性粒细胞比例升高，尿常规正常。而肾结石白细胞增高不明显，尿常规经常见潜血，有时伴有白细胞。必要时，可进行B超、CT等影像学检查以更进一步鉴别。