淀粉样变性会对多个系统器官造成影响，尤其会造成肾脏、心脏、肝脏、神经、胃肠道等病变，也可能波及肌肉和骨关节。心脏受累可能导致心脏增大、心律不整和心力衰竭，AL淀粉样变可发生在消化系统的任何部位，可能表现为便秘、腹泻、吸收不良、肠道出血、肠穿孔和缺血性肠梗阻等症状，还可能出现巨舌、牙龈增厚，肝脾肿大等症状，牙龈、舌以及直肠黏膜活检是淀粉样变诊断的常用方法之一。呼吸系统受累可能出现肺部组织中的一个或多个结节，还有可能导致呼吸困难和呼吸道出血等症状。皮肤问题通常集中在脸部和身体的其他地方，表现为皮肤增厚、肿胀、淤血、色素沉着等症状。淀粉样物质积聚在周围神经上可能导致感觉异常、肌肉萎缩、无痛溃疡，还可能引发腕管综合征。通常来说，AA蛋白常会导致肝脏、脾脏和肾脏受累，而对心脏和消化道的影响较少。AL蛋白经常损害肾脏、心脏、肝脏、舌头、周围神经和血管。