交叉性异位肾是一种泌尿系统先天畸形疾病，在胚胎发育时期由于异常发育导致，约90％的患者同时出现异位肾和对侧肾脏融合。目前尚无统一解释交叉性异位肾发生的原因，一些人认为在胚胎发育中，脐动脉位置异常可能压迫肾脏，改变其上升路径，从而导致交叉性异位。另有人认为输尿管芽可能向反方向游走，致使肾脏交叉移位。还有人认为是胚胎尾部排列与旋转异常引起的，使得脊柱末端由一侧移至另一侧，导致泄殖腔与脊柱位于同一侧或者肾脏与输尿管在上行过程中移位至对侧。