治疗方式包括药物治疗、局部理疗和手术等。根据不同病因，可以应用抗生素、抗组织胺、抗结核药物、类固醇激素和免疫抑制药物等。如患者有局部或全身感染症状以及肉芽肿性前列腺炎继发于特异性感染，就需要抗感染治疗，治疗时间通常为2~4周。对于患有哮喘或过敏的患者，还需要同时使用抗组织胺药物和适当的治疗。一般情况下，除非患有严重的尿路梗阻，否则通常不需要手术。大多数肉芽肿性前列腺炎可在不需专门治疗的情况下自行缓解，因此如果症状轻微或无症状，可以不采取治疗，并定期进行密切随访。据统计，约有2/3的患者数年后仍可能出现前列腺有包块的情况。