儿童患有鞘膜积液的并发症通常较为罕见。手术前，如果鞘膜积液较大，患侧睾丸可能会出现萎缩，较对侧睾丸小，这是一种常见并发症。另一个常见并发症是手术后鞘膜积液复发。造成这些并发症的原因可能是未进行鞘膜囊翻转，可能是囊膜具有分泌功能，或者淋巴管异常引流，或者是内环口结扎不紧密。除了上述情况，还有创口感染、感染部位渗脓、发红等并发症需进行相应处理。其他较少见的并发症包括进行多次手术仍然复发，这可能是囊性淋巴管瘤，具有分泌功能。