输精管梗阻的治疗方法主要是手术治疗，包括输精管重建术、输精管附睾连接术以及经尿道射精管切开术。 治疗射精管梗阻需要进行尿道射精管切除手术。可以通过进行输精管和附睾的连接手术来治疗附睾端输精管梗阻。对于输精管其它部位的阻塞问题，需要进行输精管吻合手术。不同的阻塞原因会影响手术的成功率，有的阻塞是由炎症引起的，还有一些是由医源性因素导致的，比如在进行腹股沟疝气手术或隐睾手术时误伤输精管。此外，也有一些男性在结扎后希望进行再通手术的情况。如果输精管阶段性堵塞是由结核病或严重炎症引起且时间较长，或者是全程梗阻的情况，那么不建议进行输精管吻合手术，具体是否需要进行此手术需要根据输精管造影检查结果确定。对于男性进行输精管结扎的逆行手术，其成功率要高于由外伤导致的输精管不通再通率。