许多药物都可能导致男性不育，而其中最常见的是西药。 首先是一种使人保持安静和放松的催眠药。在临床实践中，大剂量的苯二氮卓类药物（如阿滋定）或安定等药物可能导致勃起功能障碍；而巴比妥类药物的副作用是抑制男性脑部的睾丸激素功能。如果过度使用这些药物，会抑制机体垂体释放长期所需的正常睾丸激素量，导致体内睾酮浓度下降，从而影响男性精子质量，出现性功能问题。治疗肿瘤常用的化疗药物大多数会引起男性不育。比如环磷酰胺会破坏睾丸的精子细胞，影响其生精功能。在青春期早期或中期使用这类药物会导致睾丸萎缩。单一的苯丁酸剂量可能对性腺产生毒性，在青春期前或青春期男性使用时，可能导致少精子症的发生率为80%。第二种药物是抗菌药物，例如青霉素及其衍生物如头孢类药物可能会引起一段时间的精子减少。长期使用硫胺嘧啶也可能导致精子减少或不育，而氟康唑也可能会引发不育问题。