目前对急性肾小管间质肾炎的治疗，没有特定有效的药物。治疗主要是对症和支持性的。对于确定病因的患者，首先要消除引起疾病的因素，比如停止使用对肾脏有毒性的药物或脱离对肾脏有害的环境。对于存在原发病的肾小管间质性肾炎，特别是活跃的原发病，应首先进行有效的药物治疗以控制原发病。对于有尿路阻塞、尿液返流等情况的患者，有时需要手术治疗，并加强支持性治疗，避免对肾脏造成伤害，从而逐渐修复已受损的肾小管间质。针对急性过敏性间质性肾炎，有一些学者建议使用皮质类固醇进行治疗，认为这可能有助于缩短肾功能恢复时间，但大多数药物引起的过敏性间质性肾炎在停药后得到对症支持治疗后会较快得以恢复，因此是否使用激素需要权衡利弊。